论文查重软件的广泛应用对学术文献检索效率产生了深远的影响。首先，它大大提高了文献检索的速度和准确性。通过查重软件，研究人员能够快速找到相关文献，并排除重复或低质量的内容，节省了大量时间。其次，查重软件有助于提高文献的质量和可信度。通过对文献进行查重，可以有效减少抄袭和重复发表等学术不端行为，维护学术界的诚信和规范。此外，查重软件还能够发现文献中的相似性，有助于研究人员进行文献比较和分析，推动学术研究的深入发展。

然而，论文查重软件也存在一些挑战和局限性。首先，虽然查重软件能够快速识别文献中的相似性，但在处理某些特殊格式或语言较为复杂的文献时，其准确性可能会受到影响。此外，查重软件的使用需要费用支出，对于一些财力有限的研究机构或个人来说可能存在一定的经济压力。另外，查重软件不能替代人工审查，仍然需要研究人员进行人工判断和筛选，以确保文献的质量和准确性。因此，在使用查重软件的过程中，需要权衡其优势和劣势，结合实际情况进行合理应用。